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<title>Interaktom</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Interaktom</span></h1>

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<div id="mw-content-text" class="mw-body-content mw-content-ltr" lang="de" dir="ltr"><div class="mw-content-ltr mw-parser-output" lang="de" dir="ltr"><p>Als <b>Interaktom</b> [<style data-mw-deduplicate="TemplateStyles:r227981795">

/* start https://de.wikipedia.org/ */

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/* end https://de.wikipedia.org/ */

</style><span class="navigation-not-searchable"><span class="IPA"><a href="Liste_der_IPA-Zeichen" title="Liste der IPA-Zeichen"><span title="Aussprache im Internationalen Phonetischen Alphabet (IPA)" lang="zxx">ɪntɐʔakˈtoːm, ɪntərakˈtoːm</span></a></span></span>] wird das Gesamtnetzwerk der molekularen Wechselwirkungen in der Zelle bezeichnet. Oft wird der Begriff auf die Wechselwirkungen zwischen Proteinen eingeschränkt.<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> Die noch junge biologische Disziplin der Erforschung von Interaktomen heißt <b>Interaktomik</b> (<i>Interactomics</i>). Die Größe des Interaktoms wurde ferner als Maßstab für die Komplexität eines Organismus vorgeschlagen.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Geschichte">Geschichte</h2></div>

<p>Auch nach der vollständigen Sequenzierung verschiedener <a href="Genom" title="Genom">Genome</a>, darunter der des menschlichen Genoms im <a href="Humangenomprojekt" title="Humangenomprojekt">Humangenomprojekt</a>, blieben viele Fragen in Bezug auf das Verständnis der Funktionsweise von Organismen offen. Als einer der nächsten Schritte (vgl. <a href="-omik" title="-omik">-omik</a>) gilt das Aufdecken der Wechselwirkungen innerhalb des <a href="Proteom" title="Proteom">Proteoms</a>. Beispielsweise ist das Verständnis der komplexen <a href="Protein-Protein-Interaktion" title="Protein-Protein-Interaktion">Protein-Protein-Wechselwirkungen</a> in <a href="Signaltransduktionsweg" class="mw-redirect" title="Signaltransduktionsweg">Signaltransduktionswegen</a> ein Ansatz zur Therapie verschiedener Krankheiten wie <a href="Krebs_(Medizin)" title="Krebs (Medizin)">Krebs</a>.

</p><p>Besonders weit fortgeschritten ist die Erforschung des Interaktoms des Modellorganismus Backhefe (<i><a href="Saccharomyces_cerevisiae" class="mw-redirect" title="Saccharomyces cerevisiae">Saccharomyces cerevisiae</a></i>), dessen Proteom und Interaktom zu großen Teilen bekannt sind. Beim Menschen ist der Wissensstand diesbezüglich weit geringer: Eine auf netzwerkanalytischen Methoden beruhende Arbeit von Stumpf et al. kam zum geschätzten Ergebnis<sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>, dass das menschliche Interaktom ungefähr 650.000 Protein-Wechselwirkungen enthält, von denen derzeit weniger als 0,3 % bekannt sind<sup id="cite_ref-3" class="reference"><a href="#cite_note-3"><span class="cite-bracket">[</span>3<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>. Die Autoren schlugen außerdem die Größe des Interaktom-Netzwerks als Maß für die Komplexität eines Organismus vor. Aus den Schätzwerten folgt, dass im Gegensatz zum Genom (das Genom von <a href="Kohl" title="Kohl">Kohl</a> enthält mehr Gene als das des Menschen, siehe <a href="Genom#Genomgrößen" title="Genom">Genom#Genomgrößen</a>) das Interaktom des Menschen deutlich größer ist als das von anderen Organismen, die wir als weniger komplex bezeichnen würden. So könnte die Größe des Interaktoms unserem intuitiven Verständnis eines Komplexitätsmaßes besser entsprechen.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Methoden_zur_Erforschung_von_Interaktomen">Methoden zur Erforschung von Interaktomen</h2></div>

<p>Es gibt verschiedene Methoden zur Analyse von Protein-Protein-Wechselwirkungen, darunter <a href="Yeast_Two-Hybrid_System" class="mw-redirect" title="Yeast Two-Hybrid System">Yeast Two-Hybrid System</a> oder TAP (<i>Tandem Affinity Purification</i>). Allerdings sind viele der gegenwärtigen Techniken noch fehleranfällig.

</p><p>Es existieren verschiedene Datenbanken für Interaktom-Netzwerke, beispielsweise:

</p>

<ul><li><a href="Reactome" title="Reactome">Reactome</a></li>

<li>Database of Interacting Proteins (DIP)<sup id="cite_ref-4" class="reference"><a href="#cite_note-4"><span class="cite-bracket">[</span>4<span class="cite-bracket">]</span></a></sup></li>

<li>IntAct – The Molecular Interaction Database<sup id="cite_ref-5" class="reference"><a href="#cite_note-5"><span class="cite-bracket">[</span>5<span class="cite-bracket">]</span></a></sup></li>

<li>BioGRID<sup id="cite_ref-6" class="reference"><a href="#cite_note-6"><span class="cite-bracket">[</span>6<span class="cite-bracket">]</span></a></sup></li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Belege">Belege</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">Gavin C. K. W. Koh et al.: <i>Analyzing Protein–Protein Interaction Networks.</i> In: Journal of Proteome Research 2012 11 (4), 2014-2031 <a href="https://doi.org/10.1021/pr201211w" class="extiw external" title="doi:10.1021/pr201211w">doi:10.1021/pr201211w</a></span>

</li>

<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text">Stumpf M, Thorne T et al.: <i>Estimating the size of the human interactome.</i> <a href="PNAS" class="mw-redirect" title="PNAS">PNAS</a>, 2008, 105(19): 6959 <a href="https://doi.org/10.1073/pnas.0708078105" class="extiw external" title="doi:10.1073/pnas.0708078105">doi:10.1073/pnas.0708078105</a></span>

</li>

<li id="cite_note-3"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-3">↑</a></span> <span class="reference-text">L.A. Amaral: <i>A truer measure of our ignorance.</i> In: <a href="PNAS" class="mw-redirect" title="PNAS">PNAS</a>, 2008, 105(19):6795 <a href="https://doi.org/10.1073/pnas.0802459105" class="extiw external" title="doi:10.1073/pnas.0802459105">doi:10.1073/pnas.0802459105</a></span>

</li>

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</style><a rel="nofollow" class="external text" href="https://web.archive.org/web/20160506064315/http://bioinfow.dep.usal.es/apid/">APID (Agile Protein Interaction DataAnalizer)</a> (<span class="webarchiv-memento"><a href="Webarchivierung#Begrifflichkeiten" title="Webarchivierung">Memento</a></span> vom 6. Mai 2016 im <i><a href="Internet_Archive" title="Internet Archive">Internet Archive</a></i>)</span>

</li>

<li id="cite_note-5"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-5">↑</a></span> <span class="reference-text"><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.ebi.ac.uk/intact">IntAct</a></span>

</li>

<li id="cite_note-6"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-6">↑</a></span> <span class="reference-text"><a rel="nofollow" class="external text" href="http://www.thebiogrid.org/">BioGRID - Database of Protein and Genetic Interactions</a></span>

</li>

</ol>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<ul><li>heise.de: <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.heise.de/tp/features/Menschen-sind-komplizierter-als-Fadenwuermer-3418541.html">Menschen sind komplizierter als Fadenwürmer</a>, 14. Mai 2008</li></ul></div><div><div class="zim-footer">

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